Identificación y secuenciación de fragmentos polimórficos entre ecotipos de cocotero resistentes y susceptibles a la enfermedad del amarillamiento letal

Abstract

La selección de germoplasma de cocotero resistente a patógenos como el fitoplasma que causa la enfermedad del amarillamiento letal (AL), es una prioridad dentro de los programas de mejoramiento genético. Por lo tanto, la disposición de biomarcadores moleculares asociados a genes de resistencia (genes R) representa una herramienta esencial. En este estudio, usamos la técnica AFLP-RGC para identificar bandas polimórficas entre palmas de cocotero resistente y susceptible a la enfermedad AL. Se utilizaron un total de 24 combinaciones de cebadores a partir de las cuales se identificaron 17 fragmentos polimórficos. De los 17 fragmentos, nueve fueron de los ecotipos resistentes (AFLP-RGC 1-02, -06, -08, -09, -10, -11, -12, -13 y -17) y ocho de los susceptibles (AFLP -RGC 1-01, -03, -04, -05, -07, -14, -15 y -16). Todos los fragmentos fueron clonados y secuenciados. El análisis bioinformático reveló que nueve fragmentos de ADN (AFLP-RGC 1-01, -02, -03, -04, -06, -07, -12, -14 y -17) presentaron identidad con accesiones de GenBank, como la proteína de resistencia RPM1 de Prunus mume y el Receptor-tipo Potrean cinasa de Elaeis guineensis (AFLP-RGC 1-01 y -17, respectivamente). Las secuencias reportadas en este estudio representan una importante fuente de recursos genéticos para la identificación de potenciales marcadores moleculares asociados con la resistencia a patógenos en este cultivo.